Carcassonne, 1357. Une jeune abbesse est arrêtée pour sorcellerie par son ennemi mortel, le cardinal Chrétien, chef de l'Inquisition. On prépare les bûchers avant même le procès. Révolté par cette justice expéditive, le frère Michel, fils adoptif de Chrétien, n'a que trois jours pour recueillir la confession de l'abbesse Marie-Sybille de Cavascolle. Celle-ci va lui raconter son incroyable histoire et lui révéler ses pouvoirs : magie noire, magie blanche, guérison des lépreux.