De Gotham à Métropolis, tous les yeux sont tournés vers le ciel alors qu'une comète le traverse. Superman, Batman et Robin, conscients qu'il s'agit d'un vaisseau, interceptent l'objet avant le crash. Le passager du vaisseau, Boy Thunder, possède un énorme potentiel et devient le protégé des deux superhéros. Le Joker et The Key profitent de sa naïveté pour essayer de le faire changer de camp.